メニューの「オプション」 -> 「環境設定」をクリック

表示された環境設定ウインドウの「転送」 -> 「編集」をクリック

表示された転送設定ウインドウの「編集」をクリック

マスクの編集画面の「含めないディレクトリ」欄に「.git」を記述して「OK」をクリックでOK
半分の力で頑張ります
メニューの「オプション」 -> 「環境設定」をクリック
表示された環境設定ウインドウの「転送」 -> 「編集」をクリック
表示された転送設定ウインドウの「編集」をクリック
マスクの編集画面の「含めないディレクトリ」欄に「.git」を記述して「OK」をクリックでOK